Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Prrc2bQ7TPM1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prrc2bQ7TPM1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Prrc2bQ7TPM1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms