Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNS8

Epop, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpopQ7TNS8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EpopQ7TNS8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EpopQ7TNS8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EpopQ7TNS8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EpopQ7TNS8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EpopQ7TNS8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EpopQ7TNS8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EpopQ7TNS8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EpopQ7TNS8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EpopQ7TNS8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EpopQ7TNS8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EpopQ7TNS8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EpopQ7TNS8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EpopQ7TNS8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EpopQ7TNS8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EpopQ7TNS8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms