Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp3Q7TNH6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nphp3Q7TNH6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms