Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpf1Q7TND5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpf1Q7TND5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpf1Q7TND5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms