Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf139Q7TMV1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf139Q7TMV1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf139Q7TMV1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms