Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eci3Q78JN3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eci3Q78JN3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms