Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ssh1Q76I79 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssh1Q76I79 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms