Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpopQ6ZWS8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpopQ6ZWS8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpopQ6ZWS8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpopQ6ZWS8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpopQ6ZWS8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpopQ6ZWS8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpopQ6ZWS8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpopQ6ZWS8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpopQ6ZWS8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpopQ6ZWS8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpopQ6ZWS8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpopQ6ZWS8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SpopQ6ZWS8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpopQ6ZWS8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpopQ6ZWS8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SpopQ6ZWS8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpopQ6ZWS8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SpopQ6ZWS8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms