Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Syne2Q6ZWQ0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Syne2Q6ZWQ0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms