Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup188Q6ZQH8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup188Q6ZQH8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup188Q6ZQH8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms