Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nemp1Q6ZQE4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nemp1Q6ZQE4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms