Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
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Efr3bQ6ZQ18 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Efr3bQ6ZQ18 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Efr3bQ6ZQ18 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efr3bQ6ZQ18 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Efr3bQ6ZQ18 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efr3bQ6ZQ18 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms