Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ube2oQ6ZPJ3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ube2oQ6ZPJ3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ube2oQ6ZPJ3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms