Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY53

AY358078, HN1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY358078Q6UY53 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AY358078Q6UY53 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AY358078Q6UY53 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AY358078Q6UY53 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms