Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GcsamQ6RFH4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GcsamQ6RFH4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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