Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp2b4Q6Q477 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp2b4Q6Q477 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms