Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIX5

Rhbdf1, Inactive rhomboid protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdf1Q6PIX5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhbdf1Q6PIX5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhbdf1Q6PIX5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhbdf1Q6PIX5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms