Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp1a2Q6PIE5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1a2Q6PIE5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a2Q6PIE5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms