Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc57Q6PHN1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc57Q6PHN1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc57Q6PHN1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms