Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HjurpQ6PG16 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HjurpQ6PG16 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HjurpQ6PG16 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms