Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmeff1Q6PFE7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmeff1Q6PFE7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmeff1Q6PFE7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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