Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD7

Naif1, Nuclear apoptosis-inducing factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Naif1Q6PFD7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Naif1Q6PFD7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Naif1Q6PFD7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Naif1Q6PFD7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Naif1Q6PFD7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Naif1Q6PFD7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Naif1Q6PFD7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Naif1Q6PFD7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Naif1Q6PFD7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms