Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dhx40Q6PE54 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dhx40Q6PE54 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dhx40Q6PE54 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx40Q6PE54 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms