Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mfsd4aQ6PDC8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd4aQ6PDC8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd4aQ6PDC8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd4aQ6PDC8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd4aQ6PDC8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd4aQ6PDC8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd4aQ6PDC8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd4aQ6PDC8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd4aQ6PDC8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd4aQ6PDC8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd4aQ6PDC8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd4aQ6PDC8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd4aQ6PDC8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd4aQ6PDC8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mfsd4aQ6PDC8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mfsd4aQ6PDC8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mfsd4aQ6PDC8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mfsd4aQ6PDC8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Mfsd4aQ6PDC8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms