Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Herc4Q6PAV2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Herc4Q6PAV2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Herc4Q6PAV2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms