Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp49Q6P9L4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp49Q6P9L4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp49Q6P9L4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms