Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc148Q6P5U8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc148Q6P5U8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc148Q6P5U8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc148Q6P5U8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms