Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcf1Q6P542 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcf1Q6P542 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf1Q6P542 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms