Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RbfaQ6P3B9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RbfaQ6P3B9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RbfaQ6P3B9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RbfaQ6P3B9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RbfaQ6P3B9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RbfaQ6P3B9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RbfaQ6P3B9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RbfaQ6P3B9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RbfaQ6P3B9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RbfaQ6P3B9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.4 ms