Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Kdm2bQ6P1G2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm2bQ6P1G2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm2bQ6P1G2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm2bQ6P1G2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm2bQ6P1G2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm2bQ6P1G2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm2bQ6P1G2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm2bQ6P1G2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm2bQ6P1G2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm2bQ6P1G2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm2bQ6P1G2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms