Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SphkapQ6NSW3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SphkapQ6NSW3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SphkapQ6NSW3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms