Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NipblQ6KCD5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NipblQ6KCD5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms