Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CltbQ6IRU5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CltbQ6IRU5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms