Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tpm4Q6IRU2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm4Q6IRU2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm4Q6IRU2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm4Q6IRU2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms