Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Best3Q6H1V1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Best3Q6H1V1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Best3Q6H1V1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms