Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Smarca2Q6DIC0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Smarca2Q6DIC0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Smarca2Q6DIC0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Smarca2Q6DIC0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Smarca2Q6DIC0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Smarca2Q6DIC0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Smarca2Q6DIC0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Smarca2Q6DIC0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Smarca2Q6DIC0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Smarca2Q6DIC0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Smarca2Q6DIC0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Smarca2Q6DIC0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Smarca2Q6DIC0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Smarca2Q6DIC0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Smarca2Q6DIC0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Smarca2Q6DIC0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Smarca2Q6DIC0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Smarca2Q6DIC0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Smarca2Q6DIC0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Smarca2Q6DIC0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms