Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp11bQ6DFW5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11bQ6DFW5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11bQ6DFW5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11bQ6DFW5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11bQ6DFW5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11bQ6DFW5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11bQ6DFW5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11bQ6DFW5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11bQ6DFW5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11bQ6DFW5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11bQ6DFW5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11bQ6DFW5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11bQ6DFW5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp11bQ6DFW5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms