Protein–RNA interactions for Protein: Q6A039

Tbc1d12, TBC1 domain family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d12Q6A039 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d12Q6A039 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d12Q6A039 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d12Q6A039 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d12Q6A039 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tbc1d12Q6A039 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d12Q6A039 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d12Q6A039 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d12Q6A039 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tbc1d12Q6A039 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tbc1d12Q6A039 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tbc1d12Q6A039 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tbc1d12Q6A039 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tbc1d12Q6A039 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tbc1d12Q6A039 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms