Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ltn1Q6A009 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ltn1Q6A009 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ltn1Q6A009 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltn1Q6A009 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms