Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Jmjd1cQ69ZK6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Jmjd1cQ69ZK6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Jmjd1cQ69ZK6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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