Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnna3Q65CL1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnna3Q65CL1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ctnna3Q65CL1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnna3Q65CL1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms