Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Zeb1Q64318 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Zeb1Q64318 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Zeb1Q64318 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms