Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Surf4Q64310 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Surf4Q64310 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Surf4Q64310 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms