Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr2e1Q64104 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr2e1Q64104 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e1Q64104 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms