Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CochQ62507 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CochQ62507 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CochQ62507 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CochQ62507 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CochQ62507 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CochQ62507 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CochQ62507 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CochQ62507 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CochQ62507 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CochQ62507 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CochQ62507 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CochQ62507 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CochQ62507 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CochQ62507 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CochQ62507 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CochQ62507 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CochQ62507 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CochQ62507 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CochQ62507 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CochQ62507 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CochQ62507 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CochQ62507 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CochQ62507 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CochQ62507 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CochQ62507 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CochQ62507 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CochQ62507 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CochQ62507 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CochQ62507 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CochQ62507 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CochQ62507 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CochQ62507 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CochQ62507 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CochQ62507 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CochQ62507 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CochQ62507 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CochQ62507 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CochQ62507 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CochQ62507 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CochQ62507 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CochQ62507 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CochQ62507 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CochQ62507 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CochQ62507 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CochQ62507 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CochQ62507 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CochQ62507 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CochQ62507 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CochQ62507 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CochQ62507 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CochQ62507 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CochQ62507 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CochQ62507 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CochQ62507 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CochQ62507 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CochQ62507 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CochQ62507 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CochQ62507 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CochQ62507 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CochQ62507 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CochQ62507 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CochQ62507 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CochQ62507 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CochQ62507 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CochQ62507 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CochQ62507 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CochQ62507 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CochQ62507 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CochQ62507 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CochQ62507 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CochQ62507 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CochQ62507 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CochQ62507 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CochQ62507 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CochQ62507 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CochQ62507 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CochQ62507 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CochQ62507 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CochQ62507 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CochQ62507 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CochQ62507 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CochQ62507 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CochQ62507 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CochQ62507 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CochQ62507 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CochQ62507 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CochQ62507 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CochQ62507 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CochQ62507 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CochQ62507 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CochQ62507 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CochQ62507 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CochQ62507 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CochQ62507 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CochQ62507 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CochQ62507 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CochQ62507 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CochQ62507 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CochQ62507 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms