Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga3Q62470 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga3Q62470 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms