Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nptx1Q62443 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nptx1Q62443 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nptx1Q62443 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nptx1Q62443 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms