Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vamp1Q62442 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vamp1Q62442 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms