Protein–RNA interactions for Protein: Q62371

Ddr2, Discoidin domain-containing receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr2Q62371 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddr2Q62371 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddr2Q62371 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddr2Q62371 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddr2Q62371 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddr2Q62371 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddr2Q62371 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddr2Q62371 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddr2Q62371 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddr2Q62371 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddr2Q62371 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddr2Q62371 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddr2Q62371 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms