Protein–RNA interactions for Protein: Q62252

Spa17, Sperm surface protein Sp17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spa17Q62252 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spa17Q62252 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spa17Q62252 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Spa17Q62252 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spa17Q62252 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spa17Q62252 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spa17Q62252 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spa17Q62252 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spa17Q62252 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Spa17Q62252 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spa17Q62252 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spa17Q62252 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spa17Q62252 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spa17Q62252 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spa17Q62252 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spa17Q62252 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spa17Q62252 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spa17Q62252 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spa17Q62252 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spa17Q62252 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spa17Q62252 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spa17Q62252 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Spa17Q62252 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spa17Q62252 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Spa17Q62252 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Spa17Q62252 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spa17Q62252 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Spa17Q62252 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spa17Q62252 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms